Le vert de méthyle et la pyronine sont des colorants basiques qui se fixent sur les acides nucléiques . Le vert de méthyle colore l'ADN mais la cloration n'est pas spécifique. La pyronine colore en rose/rouge les ARN.
Coloration par le vert de méthyle seul
La chromatine (noyau interphasique, cellule en phase G0) est colorée, l'ADN a retenu le colorant.
Coloration par le vert de méthyle-pyronine
Dans le noyau, la chromatine est colorée par le vert de méthyle alors que les nucléoles sont fortement colorés par la pyronine. La chromatine correspond aux chromosomes interphasiques dont l'un des constituants est l'ADN. Au niveau des nucléoles (sans membrane) se trouvent rassemblées de nombreuses molécules d'ARN. Il s'agit de molécules d'ARNr qui sont synthétisées et assemblées en sous-unités ribosomiques au niveau des nucléoles.
Le cytoplasme est également coloré par la pyronine. Les plages roses correspondent à des zones riches en ARNr, la participation des autres ARN ( ARNt et ARNm) à la coloration étant pratiquement anecdotique.